Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf85Q96MD7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
C9orf85Q96MD7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms