Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC114Q96M63 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms