Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC11Q96J66 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms