Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
STAMBPL1Q96FJ0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms