Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHFRQ96EP1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHFRQ96EP1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms