Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIM52Q96A61 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM52Q96A61 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms