Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2A3Q93084 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms