Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO1Q92973 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms