Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RABGGTAQ92696 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
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