Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TOPBP1Q92547 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TOPBP1Q92547 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms