Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUFY2Q8WXA3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUFY2Q8WXA3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms