Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PHIPQ8WWQ0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHIPQ8WWQ0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms