Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms