Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK2A3Q8NEV1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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