Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHLHE23Q8NDY6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHLHE23Q8NDY6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms