Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TTC21AQ8NDW8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TTC21AQ8NDW8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
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