Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST4Q8NCG5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms