Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP38Q8NB14 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP38Q8NB14 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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