Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PNLDC1Q8NA58 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms