Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FSIP1Q8NA03 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FSIP1Q8NA03 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms