Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z2

CCDC71L, Coiled-coil domain-containing protein 71L, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71LQ8N9Z2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC71LQ8N9Z2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC71LQ8N9Z2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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