Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ANKRD53Q8N9V6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD53Q8N9V6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms