Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRC47Q8N1G4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC47Q8N1G4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms