Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NLGN4XQ8N0W4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLGN4XQ8N0W4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms