Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IFNL1Q8IU54 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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IFNL1Q8IU54 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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IFNL1Q8IU54 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNL1Q8IU54 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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