Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BEND4Q6ZU67 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms