Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC141Q6ZP82 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC141Q6ZP82 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms