Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWW0

LCN15, Lipocalin-15, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN15Q6UWW0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LCN15Q6UWW0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms