Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC4A10Q6U841 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC4A10Q6U841 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms