Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LRRC8EQ6NSJ5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LRRC8EQ6NSJ5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms