Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC102BQ68D86 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC102BQ68D86 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms