Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAMD13Q5VXD3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SAMD13Q5VXD3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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