Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms