Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
OBSCNQ5VST9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms