Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SAPCD1Q5SSQ6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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