Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLHL22Q53GT1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLHL22Q53GT1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms