Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRRC23Q53EV4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms