Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIN7

RGL3, Ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGL3Q3MIN7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
RGL3Q3MIN7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RGL3Q3MIN7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms