Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BSXQ3C1V8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BSXQ3C1V8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms