Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKOR2Q2VWA4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR2Q2VWA4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms