Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MICAQ29983 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MICAQ29983 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MICAQ29983 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MICAQ29983 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MICAQ29983 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MICAQ29983 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MICAQ29983 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MICAQ29983 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MICAQ29983 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MICAQ29983 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MICAQ29983 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MICAQ29983 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MICAQ29983 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MICAQ29983 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MICAQ29983 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MICAQ29983 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MICAQ29983 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MICAQ29983 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MICAQ29983 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MICAQ29983 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MICAQ29983 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MICAQ29983 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MICAQ29983 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms