Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
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PTPRNQ16849 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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PTPRNQ16849 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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PTPRNQ16849 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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PTPRNQ16849 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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PTPRNQ16849 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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PTPRNQ16849 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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PTPRNQ16849 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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PTPRNQ16849 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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PTPRNQ16849 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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PTPRNQ16849 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRNQ16849 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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