Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN1Q16658 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN1Q16658 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FSCN1Q16658 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FSCN1Q16658 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FSCN1Q16658 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FSCN1Q16658 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FSCN1Q16658 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FSCN1Q16658 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FSCN1Q16658 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FSCN1Q16658 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FSCN1Q16658 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FSCN1Q16658 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FSCN1Q16658 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FSCN1Q16658 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FSCN1Q16658 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FSCN1Q16658 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FSCN1Q16658 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FSCN1Q16658 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FSCN1Q16658 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FSCN1Q16658 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FSCN1Q16658 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms