Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFE2Q16621 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NFE2Q16621 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms