Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF239Q16600 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF239Q16600 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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