Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FXNQ16595 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FXNQ16595 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FXNQ16595 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FXNQ16595 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FXNQ16595 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
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FXNQ16595 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FXNQ16595 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FXNQ16595 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FXNQ16595 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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FXNQ16595 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FXNQ16595 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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FXNQ16595 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FXNQ16595 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FXNQ16595 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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FXNQ16595 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FXNQ16595 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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FXNQ16595 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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FXNQ16595 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FXNQ16595 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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FXNQ16595 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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FXNQ16595 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FXNQ16595 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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