Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RBBP7Q16576 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RBBP7Q16576 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms