Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNAPC1Q16533 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPC1Q16533 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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