Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ASIC2Q16515 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASIC2Q16515 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms