Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GABRA6Q16445 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GABRA6Q16445 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms